2024, 32(3):235-242.
摘要:目的]研究泰安地区冠心病患者CYP2C19、ABCB1、PON1基因型分布特点及与氯吡格雷抵抗风险的相关性。 [方法]选取2019年1月─2020年3月在泰安市中心医院住院且服用氯吡格雷治疗的冠心病患者594例,运用荧光染色原位杂交技术检测CYP2C19*2(rs4244285)、CYP2C19*3(rs4986893)、CYP2C19*17(rs12248560)、ABCB1(rs1045642)、PON1(rs662)基因型。 [结果]泰安地区冠心病患者CYP2C19*2、CYP2C19*3、CYP2C19*17基因型主要是野生纯合型(GG),其中CYP2C19*2 GG基因型频率为48.0%,CYP2C19*3 GG基因型频率为89.6%,CYP2C19*17 CC基因型频率为97.0%;ABCB1基因型主要是突变杂合型(CT),基因型频率为46.8%;PON1基因型主要是突变杂合型(AG),基因型频率为47.1%。CYP2C19*2、CYP2C19*3、CYP2C19*17、ABCB1、PON1基因型分布、等位基因分布在男性患者与女性患者中的分布差异无统计学意义(P>0.05)。泰安地区冠心病患者CYP2C19等位基因频率及代谢型分布存在显著的地区差异。在纳入研究的594名患者中,综合评价患者氯吡格雷抵抗风险度≥2的患者有287例,约占患者总数的48.3%,表明48.3%的患者常规剂量服用氯吡格雷后存在氯吡格雷抵抗。其中在风险度≥2的287例患者中,有46例CYP2C19代谢类型为正常代谢型,约占患者总数的7.7%。 [结论]泰安地区冠心病患者CYP2C19*2、CYP2C19*3、CYP2C19*17、ABCB1、PON1基因型存在多态性,ABCB1、PON1基因多态性会对约7.7%的患者用药指导结果有影响。
2023, 31(7):600-605, 631.
摘要:目的]探讨哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)基因多态性与华南地区汉族人群冠心病遗传易感的相关性,为冠心病的早期预防与干预提供新的思路。 [方法]利用聚合酶链反应-连接酶检测反应(PCR-LDR)技术对804例冠心病患者和979例对照个体的mTOR基因多态位点进行分型,检测mTOR基因的两个多态性位点rs2295079和rs1883965的基因型,用非条件Logistic回归分析统计各多态位点与冠心病易感的相关性。 [结果]rs2295079和rs1883965的等位基因、基因型频率在冠心病组与对照组中的分布均无统计学差异(P>0.05);这两个位点构建的单体型rs2295079C-rs1883965A在冠心病组与对照组中的分布频率分别是8.3%、6.5%,冠心病组显著高于对照组;携带rs2295079C-rs1883965A单体型个体罹患冠心病的风险显著增加(OR=1.29,P=0.047),该单体型在年龄≤60岁的人群中罹患冠心病的风险更为显著(OR=1.73,P=0.009)。 [结论]mTOR基因的单体型rs2295079C-rs1883965A与冠心病遗传易感密切相关,且在年龄≤60岁的人群中更加明显,提示该单体型可能是增加华南地区汉族人群冠心病发病风险的重要危险因素。
2022, 30(2):152-160.
摘要:目的 评估脂蛋白(a)基因(LPA)多态性与冠心病风险之间的相关性。方法 检索PubMed、Embase、Web of Science、Cochran、中国知网和万方数据库中LPA基因rs10455872和/或rs3798220多态性与冠心病的关联研究,检索时限均为建库至2021年6月10日。由两名研究者独立筛选文献、提取信息和评价偏倚风险。使用纽卡斯尔-渥太华评分(NOS)对各研究质量进行评分。研究间的异质性根据I2和Cochran Q检验评估,若异质性明显(I2≥50%且P<0.05)则使用随机效应模型估计比值比(OR)和95%可信区间(95%CI)。采用网状Meta分析比较不同多态性对冠心病的影响程度。采用漏斗图和Egger检验评价发表偏倚。所有分析应用RevMan 5.3和R4.0.5软件进行。P<0.05认为有统计学意义。结果 最终纳入分析的研究中,rs10455872相关研究9项,rs3798220相关研究15项。Meta分析结果表明,rs10455872_G与rs3798220_C等位基因均与冠心病显著关联(rs10455872_G:OR 1.19,95%CI 1.10~1.30;rs3798220_C:OR 1.59,95%CI 1.27~2.00)。显性模型结果表明,rs10455872_G等位基因携带者患冠心病风险较AA纯合子增加21%(OR 1.21,95%CI 1.11~1.32)),而rs3798220_C等位基因携带者患冠心病风险较TT纯合子增加59%(OR 1.59,95%CI 1.26~2.02)。网状Meta分析提示rs3798220_C携带者患冠心病风险更高。结论 LPA基因多态性与冠心病风险显著相关,携带危险等位基因的人群更需要积极预防心血管疾病。
2022, 30(4):295-303.
摘要:目的 发生在microRNA基因前体或成熟序列或靶基因3′非翻译区结合位点的单核苷酸多态性(SNP)可能通过影响microRNA对靶基因的识别调控过程,参与许多疾病如肿瘤、神经系统疾病、肌肥大、心血管疾病等的发生发展过程。本研究采用生物信息学技术分析位于miR-499a-3p种子序列第4位的SNP rs386585341 A>G可能影响生物学过程及信号通路。方法 应用RNAfold数据库预测rs386585341 A>G是否影响pre-miR-499a的二级结构,分别构建pre-miR-499a-A和pre-miR-499a-G过表达质粒检测rs386585341 A>G是否影响成熟miR-499a的表达,利用基因表达谱芯片和生物信息学分析rs386585341 A>G对miR-499a-3p功能的影响,取差异基因表达谱和TargetScan靶基因交集,分析rs386585341不同等位点miR-499a-3p-A和miR-499a-3p-G靶基因差异。结果 rs386585341 A>G不影响pre-miR-499a的二级结构,也不影响成熟miR-499a-5p和miR-499a-3p的表达水平,但影响成熟miR-499a-3p调控的靶基因网络。取差异表达基因(DEG)谱行GO和pathway分析,发现miR-499a-3p-A和miR-499a-3p-G展示不同的生物学功能,miR-499a-3p-A的下游基因网络主要富集在免疫调控方面,而miR-499a-3p-G的下游基因网络主要富集在血管新生方面;下调表达基因和TargetScan靶基因交集分析得到4个miR-499a-3p-A直接靶基因(Spry2、Pcnx、Ndufa5及Tcf7l2),而未能得到miR-499a-3p-G直接靶基因,提示miR-499a-3p种子区域第4号位由A转换成G后,调控靶基因方式可能由促进靶基因mRNA的降解转换为仅抑制靶基因的蛋白翻译。结论rs386585341 A>G可能通过影响miR-499a-3p下游调控网络在免疫和血管新生方面发挥功能。
2022, 30(6):495-500.
摘要:目的 探讨桂北地区汉族人乳脂球表皮生长因子8(MFG-E8)基因单核苷酸多态性与冠心病(CHD)的相关性。方法 选取158例桂北地区汉族CHD患者为CHD组,以年龄和性别与之匹配的183例同期健康体检者为对照组。采用酶联免疫吸附法检测CHD组和对照组血清MFG-E8水平;采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术和DNA直接测序法检测MFG-E8基因rs1878326和rs4945位点基因型;同时分析CHD组相关位点基因型与血清MFG-E8水平的关系。结果 CHD组血清MFG-E8水平为1.63(1.1,2.04)μg/L,对照组为3.29(2.9,3.59)μg/L,CHD组明显低于对照组(Z=-15.370,P<0.001)。CHD组MFG-E8基因rs4945 C>A位点CA基因型频率为31.6%,A等位基因频率为15.8%,均高于对照组(18.6%、9.3%),差异有统计学意义(P<0.05)。rs4945 C>A位点CA基因型患CHD的风险比CC基因型增大(OR=2.029,95%CI:1.229~3.349),A等位基因患CHD的风险比C等位基因增大(OR=1.835,95%CI:1.153~2.921)。CHD组rs4945 C>A位点不同基因型血清MFG-E8水平比较差异无统计学意义(Z=-1.580,P=0.114)。rs1878326 C>A位点的基因型及等位基因频率与CHD不具有相关性(P>0.05)。结论 桂北地区汉族人CHD患者血清MFG-E8水平明显低于正常人,MFG-E8基因rs4945 C>A多态性位点与CHD具有相关性。
2022, 30(11):955-960.DOI: 10.20039/j.cnki.10073949.2022.11.006
摘要:目的]探讨组织蛋白酶D基因启动子序列单核苷酸多态性与急性心肌梗死的关系。 [方法]采用病例-对照研究方法,对357例急性心肌梗死患者和347例对照人群的组织蛋白酶D基因启动子采用聚合酶链反应扩增目的基因片段并测序,结合目的基因测序后的序列及比对,GenBank上查找相对应的单核苷酸多态性位点后进行数据统计和分析。运用Hardy-Weinberg平衡检验后,应用χ2检验和t检验进行相关分析。采用Logistic回归对多种危险因素以及2个单核苷酸多态性位点与急性心肌梗死易感性进行关联性分析。用Haploview4.2软件和SHEsis在线软件进行连锁不平衡及单倍型分析。TRANSFAC数据库用于预测可能受单核苷酸多态性影响的转录因子的结合位点。 [结果]Logistic回归分析结果显示年龄增大、吸烟史、高血压病史、甘油三酯增高是急性心肌梗死的独立危险因素(P<0.05),可明显增加急性心肌梗死的患病风险;高密度脂蛋白、胆固醇是急性心肌梗死的保护因素(P<0.05),可明显降低急性心肌梗死的患病风险,此结果可能与心肌梗死组服用调脂类药物有关,需进一步扩大样本进行分析。在组织蛋白酶D基因启动子序列中的2个单核苷酸多态性位点与急性心肌梗死发病无关联性。进行连锁不平衡和单倍型分析提示,该2个单核苷酸多态性位点处于同一个连锁不平衡区域(D′=1.000,R2=0.978),单倍体型均未增加急性心肌梗死易感性(P>0.05)。 [结论]组织蛋白酶D基因启动区两个单核苷酸多态性位点为完全连锁不平衡。该2个单核苷酸多态性位点及其单倍体型与急性心肌梗死发病无相关性,但提供了组织蛋白酶D基因启动区多态性的群体遗传学资料。
2021, 29(11):1000-1006.
摘要:前蛋白转化酶枯草溶菌素9(PCSK9)是一类前蛋白转化酶家族蛋白酶K亚家族成员,可以和低密度脂蛋白受体(LDLR)结合,阻抑了LDLR的重复利用,导致肝细胞表面LDLR减少,使外周血中低密度脂蛋白胆固醇(LDLC)水平增加,从而导致血脂代谢异常等一系列病理生理过程。目前研究表明PCSK9与心肌梗死存在一定的相关性,并可能通过独立于LDLC之外的途径调控心肌梗死的发生发展。本文就PCSK9与心肌梗死的相关研究进展进行综述。
2021, 29(12):1040-1046.
摘要:目的 探讨ATG16L1基因启动子序列单核苷酸多态性(SNP)与急性心肌梗死(AMI)的相关性。方法采用病例-对照研究方法,对285例AMI患者和296例对照人群的ATG16L1基因启动子采用聚合酶链反应扩增片段并测序,结合DNA测序后的序列及比对SNP数据库后进行数据统计和分析。运用Hardy-Weinberg平衡检验后,应用χ2检验和t检验进行相关分析。采用Logistic回归对多种危险因素以及3个SNP位点与AMI易感性进行关联性分析。用Haploview 4.2软件和SHEsis在线软件进行连锁不平衡及单倍型分析。TRANSFAC数据库用于预测可能受SNP影响的转录因子的结合位点。结果 多因素Logistic回归分析结果显示男性、吸烟史、高血压是AMI的独立危险因素(P<0.05),而高密度脂蛋白胆固醇是AMI的保护因素(P<0.05)。在ATG16L1基因启动子序列中的3个SNP(rs1816753、rs12476635、rs2289477)中,rs1816753的TC基因型与AMI间存在关联,可明显增加AMI的患病风险(OR=2.519,95%CI:1.130~5.615,P=0.024)。通过Haploview 4.2软件分析显示3个SNP之间呈强连锁。结论 ATG16L1基因启动子SNP可能与AMI易感性相关,rs1816753的TC基因型可能是AMI的遗传危险因素。
2021, 29(12):1099-1104.
摘要:低密度脂蛋白受体相关蛋白6是经典Wnt信号通路的重要受体蛋白之一。该蛋白编码基因的突变与人类多种疾病相关,包括代谢综合征、肿瘤、阿尔兹海默症以及骨质疏松症等。低密度脂蛋白受体相关蛋白6的突变基因形式在临床诊断中亦具有重要的指导意义。本文将围绕低密度脂蛋白受体相关蛋白6的功能及其相关疾病作一综述。
2020, 28(7):627-633.
摘要:脂联素(APN)是脂肪组织分泌的具有心血管保护活性的多肽,其基因呈现多态性,位于启动子区(rs266729)、外显子区(rs2241766)和内含子区(rs1501299)的三个多态性位点被广泛报道与冠心病(CHD)显著相关,其他位点如rs12495941、rs822395、rs182052、rs3774261和rs17366568也有报道与CHD显著相关。在关联机制上,APN基因多态性主要通过降低血浆APN水平、引起血脂紊乱、升高血压和促进肥胖等机制而增加CHD风险。文章就APN基因多态性与CHD的相关性及关联机制作一综述。