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    • mTOR基因多态性与冠心病遗传易感的关联研究

      2023, 31(7):600-605, 631.

      关键词:哺乳动物雷帕霉素靶蛋白单核苷酸多态性单体型冠心病遗传易感
      摘要 (397)HTML (0)PDF 4.80 M (494)收藏

      摘要:目的]探讨哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)基因多态性与华南地区汉族人群冠心病遗传易感的相关性,为冠心病的早期预防与干预提供新的思路。 [方法]利用聚合酶链反应-连接酶检测反应(PCR-LDR)技术对804例冠心病患者和979例对照个体的mTOR基因多态位点进行分型,检测mTOR基因的两个多态性位点rs2295079和rs1883965的基因型,用非条件Logistic回归分析统计各多态位点与冠心病易感的相关性。 [结果]rs2295079和rs1883965的等位基因、基因型频率在冠心病组与对照组中的分布均无统计学差异(P>0.05);这两个位点构建的单体型rs2295079C-rs1883965A在冠心病组与对照组中的分布频率分别是8.3%、6.5%,冠心病组显著高于对照组;携带rs2295079C-rs1883965A单体型个体罹患冠心病的风险显著增加(OR=1.29,P=0.047),该单体型在年龄≤60岁的人群中罹患冠心病的风险更为显著(OR=1.73,P=0.009)。 [结论]mTOR基因的单体型rs2295079C-rs1883965A与冠心病遗传易感密切相关,且在年龄≤60岁的人群中更加明显,提示该单体型可能是增加华南地区汉族人群冠心病发病风险的重要危险因素。

    • 脂蛋白(a)基因多态性与冠心病相关性的Meta分析

      2022, 30(2):152-160.

      关键词:脂蛋白(a)单核苷酸多态性关联研究冠心病
      摘要 (359)HTML (0)PDF 7.31 M (716)收藏

      摘要:目的 评估脂蛋白(a)基因(LPA)多态性与冠心病风险之间的相关性。方法 检索PubMed、Embase、Web of Science、Cochran、中国知网和万方数据库中LPA基因rs10455872和/或rs3798220多态性与冠心病的关联研究,检索时限均为建库至2021年6月10日。由两名研究者独立筛选文献、提取信息和评价偏倚风险。使用纽卡斯尔-渥太华评分(NOS)对各研究质量进行评分。研究间的异质性根据I2和Cochran Q检验评估,若异质性明显(I2≥50%且P<0.05)则使用随机效应模型估计比值比(OR)和95%可信区间(95%CI)。采用网状Meta分析比较不同多态性对冠心病的影响程度。采用漏斗图和Egger检验评价发表偏倚。所有分析应用RevMan 5.3和R4.0.5软件进行。P<0.05认为有统计学意义。结果 最终纳入分析的研究中,rs10455872相关研究9项,rs3798220相关研究15项。Meta分析结果表明,rs10455872_G与rs3798220_C等位基因均与冠心病显著关联(rs10455872_G:OR 1.19,95%CI 1.10~1.30;rs3798220_C:OR 1.59,95%CI 1.27~2.00)。显性模型结果表明,rs10455872_G等位基因携带者患冠心病风险较AA纯合子增加21%(OR 1.21,95%CI 1.11~1.32)),而rs3798220_C等位基因携带者患冠心病风险较TT纯合子增加59%(OR 1.59,95%CI 1.26~2.02)。网状Meta分析提示rs3798220_C携带者患冠心病风险更高。结论 LPA基因多态性与冠心病风险显著相关,携带危险等位基因的人群更需要积极预防心血管疾病。

    • 单核苷酸多态rs386585341影响miR-499a-3p下游调控免疫和血管新生的网络

      2022, 30(4):295-303.

      关键词:单核苷酸多态性微小RNA-499a生物信息学靶基因
      摘要 (468)HTML (0)PDF 19.48 M (676)收藏

      摘要:目的 发生在microRNA基因前体或成熟序列或靶基因3′非翻译区结合位点的单核苷酸多态性(SNP)可能通过影响microRNA对靶基因的识别调控过程,参与许多疾病如肿瘤、神经系统疾病、肌肥大、心血管疾病等的发生发展过程。本研究采用生物信息学技术分析位于miR-499a-3p种子序列第4位的SNP rs386585341 A>G可能影响生物学过程及信号通路。方法 应用RNAfold数据库预测rs386585341 A>G是否影响pre-miR-499a的二级结构,分别构建pre-miR-499a-A和pre-miR-499a-G过表达质粒检测rs386585341 A>G是否影响成熟miR-499a的表达,利用基因表达谱芯片和生物信息学分析rs386585341 A>G对miR-499a-3p功能的影响,取差异基因表达谱和TargetScan靶基因交集,分析rs386585341不同等位点miR-499a-3p-A和miR-499a-3p-G靶基因差异。结果 rs386585341 A>G不影响pre-miR-499a的二级结构,也不影响成熟miR-499a-5p和miR-499a-3p的表达水平,但影响成熟miR-499a-3p调控的靶基因网络。取差异表达基因(DEG)谱行GO和pathway分析,发现miR-499a-3p-A和miR-499a-3p-G展示不同的生物学功能,miR-499a-3p-A的下游基因网络主要富集在免疫调控方面,而miR-499a-3p-G的下游基因网络主要富集在血管新生方面;下调表达基因和TargetScan靶基因交集分析得到4个miR-499a-3p-A直接靶基因(Spry2、Pcnx、Ndufa5及Tcf7l2),而未能得到miR-499a-3p-G直接靶基因,提示miR-499a-3p种子区域第4号位由A转换成G后,调控靶基因方式可能由促进靶基因mRNA的降解转换为仅抑制靶基因的蛋白翻译。结论rs386585341 A>G可能通过影响miR-499a-3p下游调控网络在免疫和血管新生方面发挥功能。

    • 桂北地区汉族人乳脂球表皮生长因子8遗传多态性与冠心病的相关性

      2022, 30(6):495-500.

      关键词:冠心病乳脂球表皮生长因子8单核苷酸多态性基因型等位基因基因频率
      摘要 (510)HTML (0)PDF 6.39 M (766)收藏

      摘要:目的 探讨桂北地区汉族人乳脂球表皮生长因子8(MFG-E8)基因单核苷酸多态性与冠心病(CHD)的相关性。方法 选取158例桂北地区汉族CHD患者为CHD组,以年龄和性别与之匹配的183例同期健康体检者为对照组。采用酶联免疫吸附法检测CHD组和对照组血清MFG-E8水平;采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术和DNA直接测序法检测MFG-E8基因rs1878326和rs4945位点基因型;同时分析CHD组相关位点基因型与血清MFG-E8水平的关系。结果 CHD组血清MFG-E8水平为1.63(1.1,2.04)μg/L,对照组为3.29(2.9,3.59)μg/L,CHD组明显低于对照组(Z=-15.370,P<0.001)。CHD组MFG-E8基因rs4945 C>A位点CA基因型频率为31.6%,A等位基因频率为15.8%,均高于对照组(18.6%、9.3%),差异有统计学意义(P<0.05)。rs4945 C>A位点CA基因型患CHD的风险比CC基因型增大(OR=2.029,95%CI:1.229~3.349),A等位基因患CHD的风险比C等位基因增大(OR=1.835,95%CI:1.153~2.921)。CHD组rs4945 C>A位点不同基因型血清MFG-E8水平比较差异无统计学意义(Z=-1.580,P=0.114)。rs1878326 C>A位点的基因型及等位基因频率与CHD不具有相关性(P>0.05)。结论 桂北地区汉族人CHD患者血清MFG-E8水平明显低于正常人,MFG-E8基因rs4945 C>A多态性位点与CHD具有相关性。

    • 组织蛋白酶D基因启动子序列单核苷酸多态性与急性心肌梗死的相关性

      2022, 30(11):955-960.DOI: 10.20039/j.cnki.10073949.2022.11.006

      关键词:基因启动子急性心肌梗死单核苷酸多态性危险因素
      摘要 (187)HTML (0)PDF 4.00 M (592)收藏

      摘要:目的]探讨组织蛋白酶D基因启动子序列单核苷酸多态性与急性心肌梗死的关系。 [方法]采用病例-对照研究方法,对357例急性心肌梗死患者和347例对照人群的组织蛋白酶D基因启动子采用聚合酶链反应扩增目的基因片段并测序,结合目的基因测序后的序列及比对,GenBank上查找相对应的单核苷酸多态性位点后进行数据统计和分析。运用Hardy-Weinberg平衡检验后,应用χ2检验和t检验进行相关分析。采用Logistic回归对多种危险因素以及2个单核苷酸多态性位点与急性心肌梗死易感性进行关联性分析。用Haploview4.2软件和SHEsis在线软件进行连锁不平衡及单倍型分析。TRANSFAC数据库用于预测可能受单核苷酸多态性影响的转录因子的结合位点。 [结果]Logistic回归分析结果显示年龄增大、吸烟史、高血压病史、甘油三酯增高是急性心肌梗死的独立危险因素(P<0.05),可明显增加急性心肌梗死的患病风险;高密度脂蛋白、胆固醇是急性心肌梗死的保护因素(P<0.05),可明显降低急性心肌梗死的患病风险,此结果可能与心肌梗死组服用调脂类药物有关,需进一步扩大样本进行分析。在组织蛋白酶D基因启动子序列中的2个单核苷酸多态性位点与急性心肌梗死发病无关联性。进行连锁不平衡和单倍型分析提示,该2个单核苷酸多态性位点处于同一个连锁不平衡区域(D′=1.000,R2=0.978),单倍体型均未增加急性心肌梗死易感性(P>0.05)。 [结论]组织蛋白酶D基因启动区两个单核苷酸多态性位点为完全连锁不平衡。该2个单核苷酸多态性位点及其单倍体型与急性心肌梗死发病无相关性,但提供了组织蛋白酶D基因启动区多态性的群体遗传学资料。

    • ATG16L1基因启动子单核苷酸多态性可增加急性心肌梗死的易感性

      2021, 29(12):1040-1046.

      关键词:急性心肌梗死ATG16L1基因启动子单核苷酸多态性转录因子
      摘要 (380)HTML (0)PDF 8.25 M (658)收藏

      摘要:目的 探讨ATG16L1基因启动子序列单核苷酸多态性(SNP)与急性心肌梗死(AMI)的相关性。方法采用病例-对照研究方法,对285例AMI患者和296例对照人群的ATG16L1基因启动子采用聚合酶链反应扩增片段并测序,结合DNA测序后的序列及比对SNP数据库后进行数据统计和分析。运用Hardy-Weinberg平衡检验后,应用χ2检验和t检验进行相关分析。采用Logistic回归对多种危险因素以及3个SNP位点与AMI易感性进行关联性分析。用Haploview 4.2软件和SHEsis在线软件进行连锁不平衡及单倍型分析。TRANSFAC数据库用于预测可能受SNP影响的转录因子的结合位点。结果 多因素Logistic回归分析结果显示男性、吸烟史、高血压是AMI的独立危险因素(P<0.05),而高密度脂蛋白胆固醇是AMI的保护因素(P<0.05)。在ATG16L1基因启动子序列中的3个SNP(rs1816753、rs12476635、rs2289477)中,rs1816753的TC基因型与AMI间存在关联,可明显增加AMI的患病风险(OR=2.519,95%CI:1.130~5.615,P=0.024)。通过Haploview 4.2软件分析显示3个SNP之间呈强连锁。结论 ATG16L1基因启动子SNP可能与AMI易感性相关,rs1816753的TC基因型可能是AMI的遗传危险因素。

    • GATA6基因启动区多态性与急性心肌梗死患者易感性和临床特征的相关性分析

      2019, 27(6):495-501.

      关键词:急性心肌梗死基因启动区单核苷酸多态性危险因素连锁不平衡
      摘要 (783)HTML (0)PDF 4.25 M (834)收藏

      摘要:目的 探讨GATA6基因启动区-493(rs144923558)G/A、-172(rs146748749)G/A 2个位点单核苷酸多态性(SNP)与急性心肌梗死(AMI)之间的关系及其相关的危险因素。方法 采用病例-对照研究方法,收集328例AMI患者和344例正常对照;应用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性技术结合DNA测序后的序列比对进行数据统计;运用Hardy-Weinberg平衡检验后,应用χ2检验进行相关分析;利用Logistic回归对多种危险因素以及2个SNP位点与AMI发病进行关联性分析;利用Haplovview4.2软件和SHEsis网站进行连锁不平衡及单倍体分析。结果 2个SNP位点共检测出3种基因型为GG、GA和AA,其基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),同时在AMI组与对照组间差异无显著性(P>0.05)。多因素Logistic回归分析:增龄、高血压病、吸烟、低密度脂蛋白胆固醇(LDLC)和甘油三酯(TG)升高是AMI发病的独立危险因素(P<0.05),HDLC为保护因素(P<0.05)。在显性、隐性和加性3种不同遗传模式下进行Logistic回归分析发现,2个SNP位点与AMI发病无关联性。进行连锁不平衡和单倍型分析提示,该2个SNP位点处于同一个连锁不平衡区域(D′=1.000,r2=1.000),单倍型GG和AA均未增加AMI易感性(P>0.05)。结论 GATA6基因启动区-493(rs144923558)G/A与-172(rs146748749)G/A两个SNP位点为完全连锁不平衡,其中GG为主要单倍型。该2个SNP位点及其单倍体型与AMI发病无相关性,但提供了GATA6基因启动区多态性的群体遗传学资料。

    • 载脂蛋白M基因rs707921位点多态性与冠心病易感性的关系

      2017, 25(7):701-704.

      关键词:载脂蛋白M冠心病单核苷酸多态性
      摘要 (958)HTML (0)PDF 2.80 M (758)收藏

      摘要:目的 检测载脂蛋白M(ApoM)基因rs707921位点的基因多态性,探讨其与冠心病(CHD)的相关性。 方法 采用单荧光标记探针技术检测111例CHD患者及248例对照组的ApoM rs707921位点单核苷酸多态性,分析其基因型和等位基因频率的分布情况。 结果 ApoM rs707921位点3种基因型(AA型、AC型和CC型)在CHD组中分布频率为1.8%、13.5%和84.7%,在对照组中分布频率为2.0%、25.4%和72.6%,两组差异有统计学意义(P=0.039);ApoM rs707921位点A、C等位基因的频率在CHD组和对照组中分布频率分别为8.6%、91.4%和14.7%、85.3%,两组比较差异有统计学意义(P=0.023)。CHD组中AC+AA基因型者甘油三酯水平显著低于CC基因型者(P=0.043)。CHD组rs707921位点多态性不同基因型间冠状动脉病变严重程度差异无统计学意义(P>0.05)。 结论 ApoM基因rs707921位点A等位基因可能降低CHD的发病风险,但与CHD的严重程度无关。

    • HSP70-hom单核苷酸多态性与高血压的关系

      2016, 24(2):163-166, 186.

      关键词:HSP70-hom单核苷酸多态性人群分布高血压
      摘要 (1064)HTML (0)PDF 3.48 M (721)收藏

      摘要:目的 探讨HSP70-hom(2437 T/C)单核苷酸多态性的人群分布特点及其与高血压的关系。方法 通过流行病学调查收集样本。采用聚合酶链反应限制性片段长度多态性的方法检测样本HSP70-hom单核苷酸多态性。总计1291例(男446例,女845例),其中高血压组359例(男138例,女221例),对照组455例(男134例,女321例),另外排除糖尿病、肝、肾、心脏病、肿瘤史者等477例。结果 HSP70-hom单核苷酸多态性的人群分布情况为基因型CC 6%、CT 38%和TT 56%,等位基因C 25%和T 75%,在男女性别之间3种基因型的分布具有统计学差异(χ2=7.96,P=0.029),等位基因的分布也具有显著差异(χ2=3.97,P=0.046)。男性高血压组和男性对照组CC+CT和TT基因型的分布差异显著(χ2=4.25,P=0.039),等位基因C和T的分布也具有统计学意义(χ2=4.769,P=0.029),而女性高血压组与女性对照组CC+CT和TT基因型及等位基因C和T的分布均无统计学差异。结论 HSP70-hom单核苷酸多态性与男性高血压发病有关,TT基因型和T等位基因可能是其易感因素。

    • 结缔组织生长因子rs9399005单核苷酸多态性与冠心病的关系

      2016, 24(12):1243-1247.

      关键词:结缔组织生长因子单核苷酸多态性冠心病
      摘要 (1194)HTML (0)PDF 4.32 M (913)收藏

      摘要:目的 探讨结缔组织生长因子(CTGF)rs9399005基因多态性与血清CTGF水平及冠心病的相关性。方法 纳入冠心病组214例和正常对照组64例,酶联免疫吸附法检测其血清CTGF水平。采用Sanger法分析CTGF基因rs9399005单核苷酸多态性(SNP)。比较两组基线临床资料、血清CTGF和基因型分布频率。非条件Logistic回归分析CTGF rs9399005 SNP与冠心病的遗传易感性,比较不同基因型CTGF水平。分析CTGF水平与冠状动脉病变支数、冠心病严重程度的关系。结果 两组年龄、吸烟、高血压、体质指数、高密度脂蛋白胆固醇、载脂蛋白A1、CTGF差异有统计学意义(P<0.05)。rs9399005基因型CC、CT、TT及等位基因C和T在两组间的分布有统计学差异(χ2值分别为12.935和17.148,均P<0.01)。携带CT发生冠心病的危险性是CC的1.134倍,TT是CC的1.406倍,T等位基因是C等位基因的1.327倍。血清CTGF水平在各基因型间差异有统计学意义(F=3.284,P=0.034)。各基因型间冠心病所累及的冠状动脉主要分支的差异有统计学意义(χ2=13.872,P=0.022)。结论 CTGF rs9399005 SNP与冠心病的遗传易感性相关;等位基因T与冠心病严重程度、冠状动脉病变支数及血清CTGF水平相关。

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