2019, 27(6):495-501.
摘要:目的 探讨GATA6基因启动区-493(rs144923558)G/A、-172(rs146748749)G/A 2个位点单核苷酸多态性(SNP)与急性心肌梗死(AMI)之间的关系及其相关的危险因素。方法 采用病例-对照研究方法,收集328例AMI患者和344例正常对照;应用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性技术结合DNA测序后的序列比对进行数据统计;运用Hardy-Weinberg平衡检验后,应用χ2检验进行相关分析;利用Logistic回归对多种危险因素以及2个SNP位点与AMI发病进行关联性分析;利用Haplovview4.2软件和SHEsis网站进行连锁不平衡及单倍体分析。结果 2个SNP位点共检测出3种基因型为GG、GA和AA,其基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),同时在AMI组与对照组间差异无显著性(P>0.05)。多因素Logistic回归分析:增龄、高血压病、吸烟、低密度脂蛋白胆固醇(LDLC)和甘油三酯(TG)升高是AMI发病的独立危险因素(P<0.05),HDLC为保护因素(P<0.05)。在显性、隐性和加性3种不同遗传模式下进行Logistic回归分析发现,2个SNP位点与AMI发病无关联性。进行连锁不平衡和单倍型分析提示,该2个SNP位点处于同一个连锁不平衡区域(D′=1.000,r2=1.000),单倍型GG和AA均未增加AMI易感性(P>0.05)。结论 GATA6基因启动区-493(rs144923558)G/A与-172(rs146748749)G/A两个SNP位点为完全连锁不平衡,其中GG为主要单倍型。该2个SNP位点及其单倍体型与AMI发病无相关性,但提供了GATA6基因启动区多态性的群体遗传学资料。
2011, 19(3):244-244.
摘要:目的载脂蛋白(Apo)A1/C3/A4/A5基因簇单核苷酸多态性(SNP)与脂质代谢和心血管病的危险密切相关,但其研究结果并不一致。本研究探讨ApoA1/C3/A5基因簇多态性和它们的单体型与血脂水平的关系。方法从我们先前分层随机整群抽样的标本库中随机抽取1030名一般人群作研究对象(男492名、女538名),年龄15~89岁。按心血管流行病学调查方法,制定统一表格询问病史、家族史、职业、生活嗜好、文化程度和体力活动等。体检包括血压、身高、体重和腰围等。全套血脂及载脂蛋白的检测。用聚合酶链反应限制片长多态性对ApoA1-75bpG>A、ApoC3 3238C>G、ApoA5-1131T>C、c.553G>T和c.457G>A基因多态性进行检测。并进行连锁不平衡和单倍型分析。结果男性高密度脂蛋白胆固醇(HDLC)和ApoA1水平明显低于女性(P<0.05)。ApoA1-75bp G>A与其余4个SNP、ApoC3 3238C>G与ApoA5-1131T>C和ApoA5-1131T>C与c.553G>T及c.457G>A有连锁不平衡。除ApoC3 3238C>G等位基因和基因型频率男女间比较有显著差异外,其余4个SNP等位基因和基因型频率男女间比较均无统计学意义。在三种ApoA1-75bp G>A基因型中,男性甘油三酯(TG)水平和女性HDLC水平及ApoA1/ApoB比值比较有统计学意义(P<0.05或P<0.01)。在三种ApoC3 3238C>G基因型中,男性HDLC和女性TG水平比较有统计学意义(P<0.05)。在三种ApoA5-1131T>C基因型中,男性总胆固醇(TC)、TG、低密度脂蛋白胆固醇(LDLC)、ApoB水平及ApoA1/ApoB比值和女性TG水平比较有统计学意义(P<0.05或P<0.01)。在两种ApoA5 c.553G>T基因型(GG与GT)中,男性TG及HDLC和女性HDLC水平比较有统计学意义(P<0.05或P<0.01)。在两种ApoA5 c.457G>A基因型(GG与GA/AA)中,男性HDLC及ApoA1和女性TC、LDLC、ApoB水平及ApoA1/ApoB比值比较有统计学意义(P<0.05或P<0.01)。在本研究人群的基因簇中有11个单体型的频率>1%。在整体水平上,5个SNP构成的单体型与7个血脂参数均有明显的关系。尤其是单体型G-A-T-C-G(6%)和G-A-T-C-G(4%)与LDLC、TC、ApoA1、ApoB水平和ApoA1/ApoB比值有一致性的联系。此外,单体型G-G-T-C-G(26%)携带者有更高的血清HDLC和ApoA1水平,而单体型G-G-C-G-G(15%)携带者有更高的血清TG、TC和ApoB水平。我们还发现,5个SNP构成的单体型比单个SNP可解释更多的血脂参数异常,尤其是对TG(单体型4.4%比?1131T>C基因型2.4%)和HDLC(单体型5.1%比c.553G>T基因型0.9%)水平。结论在ApoA1/C3/A5基因簇中,几种常见的SNP以及它们的单体型对中国一般人群的血脂水平均有不同程度的影响,尤其是它们的单体型。因此分析血脂相关基因单体型与血脂水平的关系更有临床价值。